出生于高丽忠烈王十四年戊子（1288年），相当于中国元代至元二十五年。当时高丽的首都开城。出身书香门第，其父李瑱是新进士大夫，母亲出自亦有着“三韩甲族”盛誉的月城朴氏，自幼受到良好的文化熏陶，为后来的文学创作奠定了基础。李齐贤为有着“三韩甲族”声誉的庆州李氏益斋公派派祖。

李齐贤15岁及第丙科；17岁走上仕途，任录事；22岁任职艺文春秋馆；以后五年，先后历任西海道按廉使、进贤馆提学、知密直司、政堂文学、判三司事等官职。27岁之前他已经声名远播、政绩累累。1313年，高丽第26代国王忠宣王让位于太子忠肃王，自己以太尉身份留居元朝首都大都（今北京），构置万卷堂，以书史自娱，感到“京师文学之士，皆天下之选，吾府中未有其人是吾羞也”，因召李齐贤来中国以为侍从。李齐贤1315年来中国，1341年回国，在中国生活了26年。在华期间，他遍交名士，与姚燧、阎复、赵孟頫、元明善、张养浩等过从甚密，以为知己。

他在中国还历游名山大川，足迹几遍中华。1317年，他以成均馆祭酒身份奉使峨嵋山；1319年，随忠宣王到江南降香游历；忠宣王流放吐蕃，他曾去朵思麻探望慰问，先后到过甘肃、陕西、山西、河南、河北、湖南、湖北、四川、西藏、江浙等地，可以说中国是他的第二故乡。1341年，李齐贤54岁时回国。回国后担任8岁忠穆王的老师，并编写忠烈、忠宣、忠肃三朝实录及其他史书。1348年，61岁时再次出使元朝。回国后，被恭愍王拜为右政丞。他提出许多革新建议，但屡遭拒绝，于是心灰意冷，不久便挂冠离职，专门从事著述活动。1367年（相当于中国元代至正二十七年，即高丽恭愍王十六年丁未）去世，享年80岁，谥号文忠公。