早年经历
袁恕己在长安年间官至司刑寺少卿，兼相王府司马。
拜相封王
705年（神龙元年），武则天病重。袁恕己与张柬之、崔玄暐、桓彦范、敬晖等人趁机发动兵变，诛杀张易之兄弟，拥立唐中宗复位。他随相王李旦统率南衙禁军，以防止不测，捕获韦承庆、崔神庆等张氏党羽，因功升任中书侍郎、同中书门下三品，并封银青光禄大夫、南阳郡公，不久又升任中书令，加特进。
当时，武三思仍在朝中为相。他与韦皇后私通，在中宗面前不断进谗，称袁恕己等人恃功专权，并提出明升暗降的计策。五月，桓彦范、敬晖、张柬之、崔玄暐、袁恕己五人被罢去宰相之职，加封郡王，只能在每月初一十五上朝面君。其中，袁恕己被封为南阳郡王。
贬官遇害
706年（神龙二年），袁恕己被贬出朝廷，担任豫州刺史，不久又贬为郢州刺史。不久，驸马都尉王同皎谋诛武三思，事泄被杀。武三思趁机诬陷袁恕己等人与王同皎同谋，暗中指使许州司功参军郑愔向朝廷告发。唐中宗于是将袁恕己贬为窦州司马，并剥夺封爵。
同年七月，武三思暗中命人将韦皇后淫乱后宫之事大肆宣扬，并嫁祸给袁恕己等人。唐中宗大怒，将袁恕己流放环州。不久，武三思命周利贞暗杀袁恕己。[6]周利贞知道袁恕己平时喜欢吞食黄金，便逼他喝下野葛汁。袁恕己体内毒发，疼痛难忍，以手抓地，指甲全被磨尽，但仍不能死，最终被周利贞击杀。
平反昭雪
710年（景云元年），袁恕己被追复官爵，赐谥贞烈。
718年（开元六年），唐玄宗将袁恕己的灵位放入唐中宗的宗庙中。
782年（建中三年），唐德宗又追赠袁恕己为太子太傅。
溪南北，本自一渔舟。烟雨几盟鸥。白鱼不负鸬鹚杓，青蓑不减肃鸟爽鸟裘。怎无端，贪射策，觅封侯。
既不似、古人能识字。又不似、今人能识事。空老去，自宜休。帝乡五十六朝暮，人间四十四春秋。问何如，茅一把，橘千头。
牡丹芳，牡丹芳，黄金蕊绽红玉房。
千片赤英霞烂烂，百枝绛点灯煌煌。
照地初开锦绣段，当风不结兰麝囊。
仙人琪树白无色，王母桃花小不香。
宿露轻盈泛紫艳，朝阳照耀生红光。
红紫二色间深浅，向背万态随低昂。
映叶多情隐羞面，卧丛无力含醉妆。
低娇笑容疑掩口，凝思怨人如断肠。
浓姿贵彩信奇绝，杂卉乱花无比方。
石竹金钱何细碎，芙蓉芍药苦寻常。
遂使王公与卿士，游花冠盖日相望。
庳车软舆贵公主，香衫细马豪家郎。
卫公宅静闭东院，西明寺深开北廊。
戏蝶双舞看人久，残莺一声春日长。
共愁日照芳难驻，仍张帷幕垂阴凉。
花开花落二十日，一城之人皆若狂。
三代以还文胜质，人心重华不重实。
重华直至牡丹芳，其来有渐非今日。
元和天子忧农桑，恤下动天天降祥。
去岁嘉禾生九穗，田中寂寞无人至。
今年瑞麦分两岐，君心独喜无人知。
无人知，可叹息。
我愿暂求造化力，减却牡丹妖艳色。
少回卿士爱花心，同似吾君忧稼穑。
