夫医道所兴，其来久矣。上古神农始尝草木而知百药。黄帝咨访岐伯、伯高、少俞之徒，内考五脏六腑，外综经络血气色候，参之天地，验之人物，本性命，穷神极变，而针道生焉。其论至妙，雷公受业传之于后。伊芳尹以亚圣之才，撰用《神农本草》以为汤液。中古名医有俞跗、医缓、扁鹊，秦有医和，汉有仓公。其论皆经理识本，非徒诊病而已。汉有华佗、张仲景。其它奇方异治，施世者多，亦不能尽记其本末。若知直祭酒刘季琰病发于畏恶，治之而瘥，云∶后九年季琰病应发，发当有感，仍本于畏恶，病动必死，终如其言。仲景见侍中王仲宣时年二十余，谓曰∶君有病，四十当眉落，眉落半年而死，令服五石汤可免。仲宣嫌其言忤，受汤而勿服。居三日，见仲宣谓曰∶服汤否？仲宣曰∶已服。仲景曰终如其言。此二事虽扁鹊、仓公无以加也。华佗性恶矜技，终以戮死。仲景论广伊芳尹汤液为数十卷，用之多验。近代太医令王叔和撰次仲景，选论甚精，指事可施用。按∶《七略·艺文志》，《黄帝内经》十八卷。今有《针经》九卷，《素问》九卷，二九十八卷，即《内经》也。亦有所亡失，其论遐远，然称述多而切事少，有不编次。比按仓公传，其学皆出于《素问》，论病精微。《九卷》是原本经脉，其义深奥，不易觉也。又有《明堂孔穴针灸治要》，皆黄帝岐伯选事也。三部同归，文多重复，错互非一。甘露中，吾病风加苦聋，百日方治，要皆浅近，乃撰集三部，使事类相从，删其浮辞，除其重复，论其精要，至为十二卷。《易》曰∶观其所聚，而天地之情事见矣。况物理乎？事类相从，聚之义也。夫受先人之体，有八尺之躯，而不知医事，此所谓游魂耳。若不精通于医道，虽有忠孝之心，仁慈之性，君父危困，赤子涂地，无以济之，此固圣贤所以精思极论尽其理也。由此言之，焉可忽乎？其本论其文有理，虽不切于近事，不甚删也。若必精要，后其闲暇，当撰核以为教经云尔。
林序
林序皇甫序
皇甫序序例
序例卷一
精神五脏论第一 五脏变第二 五脏六腑阴阳表里第三 五脏六腑官第四 五脏大小六腑应候第五 十二原第六 十二经水第七 四海第八 气息周身五十营四时十 营气第十 营卫三焦第十一 阴阳清浊精气津液血脉 津液五别第十三 奇邪血络第十四 五色第十五 阴阳二十五人形性血气卷二
十二经脉络脉支别第一 十二经脉络脉支别第一 奇经八脉第二 脉度第三 十二经标本第四 经脉根结第五 经筋第六 骨度肠度肠胃所受第七卷三
头直鼻中发际傍行至头 头直鼻中入发际一寸循 头直侠督脉各一寸五分 头直目上入发际五分却 头缘耳上却行至完骨凡 头自发际中央傍行凡五 背自第一椎循督脉下行 背自第一椎两傍侠脊各 背自第二椎两傍侠脊各 面凡二十九穴第十 耳前后凡二十穴第十一 颈凡十七穴第十二 肩凡二十八穴第十三 胸自天突循任脉下行至 胸自输府侠任脉两傍各 胸自气户侠输府两傍各 胸自云门侠气户两傍各 腋胁下凡八穴第十八 腹自鸠尾循任脉下行至 腹自幽门挟巨阙两傍各 腹自不容侠幽门两傍各 腹自期门上直两乳侠不 腹自章门下行至居凡十 手太阴及臂凡一十八穴 手厥阴心主及臂凡一十 手少阴及臂凡一十六穴 手阳明及臂凡二十八穴 手少阳及臂凡二十四穴 手太阳凡一十六穴第二 足太阴及股凡二十二穴 足厥阴及股凡二十二穴 足少阴及股并阴跷阴维 足阳明及股凡三十穴第 足少阳及股并阳维四穴 足太阳及股并阳跷六穴卷四
经脉第一（上） 经脉第一（中） 经脉第一（下） 病形脉诊第二（上） 病形脉诊第二（下） 三部九候第三卷五
针灸禁忌第一（上） 针灸禁忌第一（下） 九针九变十二节五刺五 缪刺第三 针道第四 针道终始第五 针道自然逆顺第六 针道外揣纵舍第七卷六
八正八虚八风大论第一 逆顺病本末方宜形志大 五脏六腑虚实大论第三 阴阳清浊顺治逆乱大论 四时贼风邪气大论第五 内外形诊老壮肥瘦病旦 阴阳大论第七 正邪袭内生梦大论第八 五味所宜五脏生病大论 五脏传病大论第十 寿夭形诊病候耐痛不耐 形气盛衰大论第十二卷七
六经受病发伤寒热病第 六经受病发伤寒热病第 六经受病发伤寒热病第 足阳明脉病发热狂走第 阴衰发热厥阳衰发寒厥 太阳中风感于寒湿发第 阴阳相移发三疟第五卷八
五脏传病发寒热第一（ 五脏传病发寒热第一（ 经络受病入肠胃五脏积 五脏六腑胀第三 水肤胀鼓胀肠覃石瘕第 肾风发风水面肿第五卷九
大寒内薄骨髓阳逆发头 寒气客于五脏六腑发卒 邪在肺五脏六腑受病发 肝受病及卫气留积发胸 邪在心胆及诸脏腑发悲 脾受病发四肢不用第六 脾胃大肠受病发腹胀满 肾小肠受病发腹胀腰痛 三焦膀胱受病发少腹肿 三焦约内闭发不得大小 足厥阴脉动喜怒不时发 足太阳脉动发下部痔脱卷十
阴受病发痹第一（上） 阴受病发痹第一（下） 阳受病发风第二（上） 阳受病发风第二（下） 八虚受病发拘挛第三 热在五脏发痿第四 手太阴阳明太阳少阳脉 水浆不消发饮第六卷十一
胸中寒发脉代第一 阳厥大惊发狂痫第二 阳脉下坠阴脉上争发尸 气乱于肠胃发霍乱吐下 足太阴厥脉病发溏泄下 五气溢发消渴黄瘅第六 动作失度内外伤发崩中 邪气聚于下脘发内痈第 寒气客于经络之中发痈 寒气客于经络之中发痈卷十二
欠哕唏振寒噫嚏泣出太 寒气客于厌发喑不能言 目不得眠不得视及多卧 足太阳阳明手少阳脉动 手太阳少阳脉动发耳病 手足阳明脉动发口齿病 血溢发衄第七（鼻鼽息 手足阳明少阳脉动发喉 气有所结发瘤瘿第九 妇人杂病第十 小儿杂病第十一