针灸穴治大同，但头面诸阳之会。胸膈二火之地，不宜多灸。背腹阴虚有火者，亦不宜灸，惟四肢穴最妙。凡上体及当骨处，针入浅而灸宜少；凡下体及肉厚处，针可入深灸多无害。前经络注《素问》未载针灸分寸者，以此推之。
手部
曲池：主中风，手挛筋急，痹风，疟疾先寒后热。
肩井：主肘臂不举，扑伤。
肩髃：主瘫痪，肩肿，手挛。
三里：主偏风下牙疼。
合谷：主中风，破伤风，痹风，筋急疼痛，诸般头病，水肿，难产，小儿急惊风。
三间：主下牙疼。
二间：主牙疾，眼疾。
支正：主七情气郁，肘臂十指皆挛及消渴。
阳谷：主头面手膊诸疾，及痔痛，阴痿。
腕骨：主头面、臂腕、五指诸疾。
后溪：主疟疾，癫痫。
少泽：主鼻衄不止，妇人乳肿。
间使：主脾寒症，九种心痛，脾疼，疟疾，口渴。如瘰疬久不愈，患左灸右，患右灸左。
大陵：主呕血，疟。
内关：主气块，及胁痛，劳热，疟疾，心胸痛。
劳宫：主痰火胸痛，小儿口疮，及鹅掌风。
中渚：主手足麻木，战战蜷挛，肩臂连背疼痛，手背痈毒。
神门：主惊悸怔忡，呆痴，卒中鬼邪，恍惚振禁，小儿惊痫。
少冲：主心虚胆寒，怔忡癫狂。
少商：主双蛾风，喉痹。
列缺：主咳嗽风痰，偏正头风，单蛾风，下牙疼。
足部
环跳：主中风湿，股膝挛痛，腰痛。
风市：主中风，腿膝无力，脚气，浑身瘙痒，麻痹。
阳陵泉：主冷痹偏风，霍乱转筋。
悬钟：主胃热腹胀，胁痛，脚气，脚胫湿痹，浑身瘙痒，趾疼。
足三里：主中风中湿，诸虚耳聋，上牙疼，痹风，水肿，心腹鼓胀，噎膈哮喘，寒湿脚气。上、中、下部疾，无所不治。
丰隆：主痰晕，呕吐哮喘。
内庭：主痞满。患右灸左，患左灸右，觉腹响是效。及妇人食蛊，行经头晕，小腹痛。
委中：治同环跳症。
承山：主痔漏，转筋。
飞扬：主行步如飞。
金门：主癫痫。
昆仑：主足腿红肿，齿痛。
申脉：主昼发痓，足肿，牙痛。
血海：主一切血疾及诸疮。
阴陵泉：主胁腹胀满，中、下部疾皆治。
三阴交：主痞满痼冷，疝气，脚气，遗精，妇人月水不调，久不成孕，难产，赤白带下，淋漓。
公孙：主痰壅胸膈，肠风下血，积块，妇人气蛊。
太冲：主肿满，行步艰难，霍乱，手足转筋。
行间：主浑身蛊胀，单腹蛊胀，妇人血蛊。
大敦：主诸疝，阴囊肿，脑衄，破伤风，小儿急慢惊风等症。
隐白：主心脾痛。
筑宾：主气疝。
照海：主夜发痓，大便闭，消渴。
太溪：主消渴，房劳，不称心意，妇人水蛊。
然谷：主喉痹，唾血，遗精，温疟，疝气，足心热，小儿脐风。
涌泉：主足心热，疝气，贲豚，血淋，气痛。
背部
大杼：主偏身发热，瘅疟咳嗽。
神道：主背上怯怯乏气。
至阳：主五疸痞满。
命门：主老人肾虚腰疼，及诸痔脱肛，肠风下血。
风门：主易感风寒，咳嗽痰血，鼻衄，一切鼻病。
肺俞：主内伤外感，咳嗽吐血，肺痈，肺痿，小儿龟背。
膈俞：主胸胁心痛，痰疟痃癖，一切血疾。
肝俞：主吐血，目暗，寒疝。
长强：主痔漏。
胆俞：主胁满，干呕，惊怕，睡卧不安，酒疸目黄，面发赤斑。
脾俞：主内伤脾胃，吐泄，疟，痢，喘急，黄疸，食症，吐血，小儿慢脾风。
三焦俞：主胀满积块，痢疾。
胃俞：主黄疸，食毕头眩，疟疾，善饥不能食。
肾俞：主诸虚，令人有子，及耳聋，吐血，腰痛，女劳疸，妇人赤白带下。
小肠俞：主便血下痢，便黄赤。
大肠俞：主腰脊痛，大小便难，或泄痢。
膀胱俞：主腰脊强，便难腹痛。
凡五脏疟，灸五脏俞。
譩嘻：主诸疟，久疟眼暗。
意舍：主胁满呕吐。
腹部
膻中：主哮喘，肺痈，咳嗽，瘿气。
巨阙：主九种心痛，痰饮吐水，腹痛，息贲。
上脘：主心痛，伏梁，贲豚。
中脘：主伤者，及内伤脾胃，心脾痛，疟疾，痰晕，痞满，翻胃，能引胃中生气上行。
水分：主鼓胀绕脐，坚满不食，分利水道，止泄。
神阙：主百病及老人、虚人泄泻如神。又治水肿，鼓胀，肠鸣，卒死，产后腹胀，小便不通，小儿脱肛。
气海：多灸能令人生子。主一切气疾，阴症痼冷，及风寒暑湿，水肿，心腹鼓胀，胁痛，诸虚症瘕，小儿囟不合。丹溪治痢，昏仆上视，溲注汗泄，脉大，得之酒色，灸此后，服人参膏而愈。
关元：主诸虚肾积及虚，老人泄泻，遗精白浊，令人生子。
中极：主妇人下元虚冷，虚损，月事不调，赤白带下。灸三遍，令生子。
天枢：主内伤脾胃，赤白痢疾，脾泄及脐腹鼓胀，症瘕。
章门：主痞块，多灸左边。肾积，灸两边。
乳根：主膺肿，乳痈，小儿龟胸。
日月：主呕宿汁，吞酸。
大赫：主遗精。
带脉：主疝气偏坠，水肾，妇人带下。
头部
百会：主诸中风等症，及头风，癫狂，鼻病，脱肛，久病大肠气泄，小儿急慢惊风，痫症，夜啼，百病。
上星：主鼻渊，鼻塞，息肉及头风目疾。
神庭：主风痫，羊癫。
通天：主鼻痔。左臭灸右，右臭灸左；左右臭，左右灸，鼻中去一块如朽骨，臭气自愈。
脑空：主头风，目眩。
翳风：主耳聋及瘰疬。
率谷：主伤酒呕吐，痰眩。
风池：主肺中风，偏正头风。
颊车：主落架风。
卷一
针道源流 针灸直指 刺热论 刺疟论 刺咳论 刺腰痛论 奇病论 刺要论 刺齐论 刺志论 长刺节论 皮部论 经络论 骨空论 刺水热穴论 调经论 缪刺论 经刺论 巨刺论 卫气行论 诊要经终论 刺禁论 刺法论 五刺应五脏论 九刺应九变论 十二刺应十二经论 手足阴阳经脉刺论 标本论 难经卷二
周身经穴赋（医经小学 百症赋（聚英） 标幽赋（杨氏注解） 席弘赋（针灸大全） 金针赋（杨氏注解） 玉龙赋（聚英） 通玄指要赋（杨氏注解 灵光赋（针灸大全） 兰江赋（杨氏书） 流注指微赋（窦氏）卷三
五运主病歌（医经小学 六气为病歌 百穴法歌（神应经） 十二经脉歌（聚英） 玉龙歌（杨氏注解） 胜玉歌（杨氏） 杂病穴法歌（医学入门 杂病十一穴歌 长桑君天星秘诀歌 马丹阳天星十二穴治杂 四总穴歌 肘后歌 回阳九针歌 针内障秘歌（杨氏） 针内障要歌 补泻雪心歌（聚英） 行针总要歌 行针指要歌 刺法启玄歌（六言） 针法歌 策卷四
背部俞穴歌 腹部中穴歌 中指取寸 素问九针论 内经补泻 难经补泻 神应经补泻 南丰李氏补泻 四明高氏补泻 三衢杨氏补泻 生成数（聚英） 经络迎随设为问答（杨 禁针穴歌 禁灸穴歌 太乙歌 尻神禁忌 人神禁忌卷五
十二经井穴（杨氏） 井荥俞原经合歌（医经 徐氏子午流注逐日按时 十二经纳干支歌 流注图 论子午流注法（徐氏） 流注开阖（医学入门） 流注时日 臟腑井滎俞經合主治（ 十二经是动所生病补泻 十二經之原歌 十二经病井荥俞经合补 十二经气血多少歌 十二经治症主客原经（ 九宮歌 八法歌 八法交会八脉 八法交会歌 八法交会八穴歌 八脉配八卦歌 八穴配合歌 刺法启玄歌（五言） 八法五虎建元日时歌 八法逐日干支歌 八法临时干支歌 八脉图并治症穴 八法手诀歌（聚英）卷六
五脏六腑 十四经脉长短尺寸 脏腑十二经穴起止歌 手太阴肺经 手阳明大肠经 足阳明胃经 足太阴经穴主治 手少阴心经 手太阳小肠经 足太阳膀胱经 足少阴肾经卷七
手厥阴心包经 手少阳三焦经 足少阳胆经 足厥阴肝经 任脉 督脉 督任要穴（杨氏） 奇经八脉歌（医经小学 奇经八脉（节要） 十五络脉歌（医经小学 十五络脉穴辨（医统） 十五络脉（节要） 十二经筋（节要） 五脏募穴（聚英） 八会 看部取穴 治病要穴（医学入门） 经外奇穴（杨氏） 穴同名异类（聚英）卷八
穴法（神应经） 诸风门 伤寒门 痰喘咳嗽门 诸般积聚门 腹痛胀满门 心脾胃门 心邪癫狂门 霍乱门 疟疾门 肿胀门（附：红疸黄疸 汗门 痹厥门 肠痔大便门 阴疝小便门 头面门 咽喉门 耳目门 鼻口门 胸背胁门 手足腰腋门 妇人门 小儿门 疮毒门 续增治法卷九
治症总要（杨氏） 东垣针法（聚英） 名医治法（聚英） 孙真人针十三鬼穴歌 捷要灸法（医学入门） 崔氏取四花穴法 取膏肓穴法（医学入门 骑竹马灸穴法 灸劳穴法（聚英）；取 取灸心气法；取灸痔漏 灸结胸伤寒法；灸阴毒 雷火针法；蒸脐治病法 相天时；千金灸法；宝 艾叶医统；艾灸补泻； 壮数多少；灸法；炷火 灸寒热；灸疮要法；贴 灸疮膏法；洗灸疮；灸 医案（杨氏）卷十
保婴神术（按摩经） 手法歌 观形察色法 面部五位歌 命门部位歌 阳掌图各穴手法仙诀 阴掌图各穴手法仙诀 小儿针 初生调护 面色图歌 察色验病生死诀 汤氏歌 内八段锦 外八段锦 入门歌 三关 六筋 治小儿诸惊推揉等法 补遗